高效液相色譜柱是由柱管、壓帽、卡套(密封環)、篩板(濾片)、接頭、螺絲等組成。柱管的材質有很多，比如聚合物、玻璃、不銹鋼等。但是建議柱管用不銹鋼材質，因為不銹鋼這種金屬耐高壓、耐腐蝕且硬度高，相比于玻璃等材質不易摔壞。不過當壓力不高于70Kg/cm2時，也可采用厚壁玻璃或石英管。對于色譜柱柱管內壁要求有很高的光潔度，不銹鋼柱內壁會經過多次拋光，這是為提高柱效，減小管壁效應。0.1μm高光潔度色譜柱柱管能夠快速分析的同時保持超高的柱效;使用壽命長，不僅能夠減少頻繁更換色譜柱帶來的重新進行方法驗證、條件摸索等工作，還大大的降低了使用成本;具備優良的選擇性和分離能力。
除了拋光，也有在不銹鋼柱內壁涂敷氟塑料來提高內壁的光潔度，其效果與拋光是相同的。色譜柱兩端的柱頭內裝有篩板，通常是不銹鋼和peek材質制作的，根據需求選擇與色譜柱匹配的柱篩板，孔徑取決于填料粒度，目的是防止填料漏出。
柱內徑一般是根據柱長、填料粒徑和折合流速來確定，目的是為了避免管壁效應。
高效液相色譜柱的柱長及內徑的選擇原則是什么?長度的選擇：柱越長，總柱效越高(n值越大)，柱越長，分析時間也越長。250—300mm是普遍的柱長，實驗室一半以上的工作都是采用此規格柱子，一般用來分離l0到50個組份的中等至復雜混合物;500—600mm，要求較高分辨率的應用，—般用來分離大于50個組份或包含有難分離物質的復雜樣品程序升溫分析。
內徑：柱效率與柱半徑平方成反比，內徑越小柱效越高，但內徑越大，柱容量也增加，允許進樣量就越多。當進樣量超過柱容量時，則因柱內每塊理論板內不能建立真正的平衡，將會導致色譜峰畸變，柱分辨率降低，重現性不好。因此對于復雜樣品需要準確分離，必須使用小內徑柱子。另一方面若樣品中存在具有很不相同濃度組份化合物，為了增加樣品容量就必須使用內徑大的柱子，目前實驗室使用常見的柱子內徑一般是4.6mm。
分析大分子量化合物選擇大孔徑高效液相色譜柱;對于高pH值或者堿性化合物需要選擇高封端或者特殊封端的色譜柱，以改善峰形，延長色譜柱使用壽命等。色譜柱內徑有2.1、3.0、4.6、10mm可供選擇，不銹鋼材質不易因為磕碰損壞柱管。
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